高通量DNA打斷儀是二代測序文庫構建中,用于將大片段基因組DNA批量剪切為目標長度小片段的自動化設備,能實現多樣本平行處理,相比超聲破碎法更高效、均一性更好,是高通量測序實驗室的核心設備。
高通量DNA打斷儀主要采用非接觸式聚焦超聲技術(AFA)來實現對DNA分子的“冷”剪切:
超聲空化效應:儀器通過高頻超聲波在液相中產生無數微小的氣泡(空化泡),這些氣泡瞬間崩潰時會產生大的局部剪切力,從而將溶液中的DNA分子隨機拉斷。
非接觸與封閉處理:樣本全程密封在獨立的離心管或孔板中,超聲波通過水浴介質隔著管壁傳遞能量。這種設計避免了傳統探頭超聲帶來的金屬碎屑污染、氣溶膠交叉感染以及樣本損耗。
準確的溫控系統:打斷過程中產生的熱量易導致DNA變性降解。
相比手動超聲破碎,高通量DNA打斷儀的優勢:
支持同時處理8/24/96個樣本,批量處理效率高,適配高通量測序多樣本建庫需求;
可準確控制DNA片段長度,能實現100bp-5kb不同范圍的片段化,滿足不同測序讀長要求;
溫控準確,一般帶循環冷卻系統,避免超聲產熱導致DNA降解或修飾損傷;
自動化程序控制,無需人工值守,重復性好,不同批次打斷結果一致性高。